- San Juan de Cochero
- San Juanpampa
- San Luis
- San Miguel
- San Pedro de Cani
- San Sebastian de Quera
- Santa María del Valle
- Santo Domingo
- Seclín
- Secsipucro
- Sera Ucru
- Shacha
- Shairicancha
- Shalla
- Shalla Marca
- Shallacancha
- Shapulo
- Shayhua
- Shiracalla
- Shiracapata
- Shiri Pata
- Shishmay
- Shogosmonte
- Shone
- Shunshuya
- Shunturcancha
- Sirabamba
- Sirau
- Siricancha
- Socatambo