- Stasiškiai
- Staskūniškis
- Staškūniškis
- Steponava
- Sterkiškis
- Sterkonys
- Storiai
- Stukonys
- Sudeikiai
- Surdaugiai
- Surdegis
- Surdegis
- Survilai
- Surviliškis
- Surviliškis
- Svėdasai
- Šventupys
- Sviesteliškis
- Svileliai
- Svirnai I
- Svirnai II
- Sabališkė
- Sadūniškė
- Šakaraistis
- Šakarva
- Šakeliškė
- Saksoniškė
- Salelė
- Salomenka
- Salos